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안녕하세요. 메뚜기 계통분류 관련으로 여쭤봅니다.
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 김건혁
(Homepage) |
2020-02-05 22:15:26, 조회 : 316, 추천 : 65 |
벌써 2020년 신정과 구정이 다 지났습니다.
메뚜기 홈페이지의 모든 분들 새해 복 많이 받으시고 건강하시기를 빕니다.
최근에 모노그래프, 여치과 및 다른 곤충목의 논문을 많이 보면서, 외형적 분류-형질, 가시적 차이, 생식기 구조 등-만 나와있는 논문보다는 유전자(핵, 미토콘드리아 및 단백질의 서열구조)를 이용한 분자생물학적 분류의 비중이 크게 늘어나고, 어떤 분류군에서는 핵형으로 근연관계를 유추하거나, 화석 기록으로 prehistoric lineage까지 살펴보는 비중이 많아졌습니다.
특히 메뚜기는 유럽 쪽에서 연구가 활발히 되고 있었고, polyneoptera 류의 진화관계를 유추하는 논문도 여럿 볼 수 있었습니다.
앞으로 메뚜기뿐만 아니라 다른 곤충 분류군에서도 이렇게 계통분석이 차츰 이루어질텐데, 아직 모르는 부분이 많습니다.
특히 외형에서 중요시했던 특정 형질(다리, 날개, 미모 및 생식기 구조)과 유전자 분석간의 차이로 어떻게 종을 규명하냐의 문제도 발생한다고 알고 있습니다.
따라서 계통학을 이해해야 논문은 물론 종을 어떻게 정하느냐까지 이해할 수 있을텐데, 아쉽게도 논문에서는 누가 이런 방법을 이용했다, material로는 어떤걸 썼다, 결론적으로 밝혀낸건 이것이다, 등의 내용이 있고 기본적으로 왜 그 방법을 썼는지, 왜 특정 염기서열(또는 특정 프라이머)을 이용했는지, 왜 그렇게 밝혀낸건지, 왜 그게 메뚜기에서 중요한지 에 대해서는 명확하게 이해할 수 없었습니다. (예를 들어 갈색여치와 팔공여치의 경우 미토콘드리아 유전자 염기서열을 분석한 결과 유전적으로 4~7%의 차이가 나는데, 왜 미토콘드리아 CO1, 2, ND1, 2 유전자를 이용한건지, 유전적으로 4% 이상이 차이가 나면 왜 다른 종으로 규명할 수 있는지, 메뚜기목에서 자주 증포되는 서열을 왜 있는지, 또 그걸 왜 제거해야 하는지 등...)
계통분류학적 지식이 많이 부족한 일반인이 기본적으로 계통학이 왜 중요한지, 각 염기서열(핵, 미토콘드리아, 사이토크롬, 단백질 도메인 등...)에서 이용되는 부분과 왜 그걸 쓰는지, 계통도를 어떻게 이해해야 하는지(서열 선택과 계통도 작성 및 이해 방법?), 메뚜기목에서는 계통학이 어떻게 적용될 수 있는지, 유전적 차이와 개체변이 그리고 이종관계를 서로 어떻게 이해하고 규명해야 하는지 등에 관하여 이해하고 공부할 수 있는 자료가 있는지 알고 싶습니다. 혹여나 메뚜기목 phylogeny 관련한 서적이 있다면 참고하도록 하겠습니다.
곤충을 쭉 공부하면서 기존에 알던 것과 다른 새로운 방법이 다가오니 약간 낯설게 느껴지는 것도 있고, 눈으로만 구별했지 직접 해본 경험이 없어서 스스로 많이 부족하다고 생각하는 것 같기도 합니다. 앞으로 곤충을 쭉 하는데 있어 필수적인 요소다 보니 차근차근 알아가고 싶습니다.
궁금한 게 너무 많아서 실례드립니다. 도움이 많이 필요합니다. 감사합니다. ^^ |
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| 여치 |
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유전자를 분석할려면 흔히 marker 라고 말하는 유전자 전체 (염색체) 에서 분석하고자하는 부분의 정보가 필요합니다. 그러한 분석을 하다보면 일단은 돌연변이가 적고 가장 안정적인 유전자 부분을 비교분석을 합니다. 왜냐면 돌연변이가 지나치게 많이 나오는 유전자 부분의 경우는 비교분석의 안정성이 떨어지니까요. 그래서 연구목적 즉 가설에 따라서 아주 긴 제놈중에서 보고자 하는 유전자부분 (예를 들면 마토콘드리아이든 마이크로 세트라이트 등등)을 추출한후 그추출된 유전자 안에서 (예를 들면 마토콘드리아 유전자 안)에서 또 안정적 유전자 염기 부분 (sequence) (예를 들면 여기서는 COI sequence) 를 잘라서 그 유전자를 피씨아를 통해서 복제를 한후 비교분석을 하는것 입니다. 제가 제안하고 싶은것은 분자생물학자들에게 문희하거나 분자생물학책을 참고 하지 마시고 (여기에 나오는 내용은 저희가 알고자 하는것과 관계없이 깊이들어가는 내용이니까요.) 분자 생태학자에게 문의를 구하거나 아니면 분자 생태학에 관한책을 참고하시기 바랍니다. 예를 들면 저희는 통계학을 활용해서 어떻해 쓰는지 어떻해 분석하는지만 알면 되는것이지 통계학을 전문적으로 하는 사람들 처럼 통계학에 쓰이는 각종 공식들을 미적분및 등등 수학적 관점으로 파고드는것은 아니잖습니까? 똑같이 유전자 검사를 생태학이나 동물학에 어떻해 적용하고 분석하는지만 알면 되는것이지 구태여 왜 이런 화학재료를 쓰고 왜 이리 섞어서 하고 하는 호기심은 아무래도 저희 연구와는 관계도 없고 저희쪽 계통 사람들은 잘 알지도 못합니다. 즉 뭘 하고 있다는것만 알고 이게 뭔지만 알면 되는것이지 그부분은 구태여 깊이 파고들 필요가 없습니다. 왜 4% 이상이 나면 다른종이냐? 분명히 그 논문에 어떤 통계분석을 사용해 계통분류도를 그렸고 어떤 프로그램을 사용했는지 나와있을것입니다. 거기에 따라서 그부분은 달라지는 기준입니다. 일단 마이토콘드리아 유전자는 암컷의 하프로이드에서만 나오기 때문에 수컷만이 가지고 있는 유전자 정보를 보는데는 아무래도 조금 무리가 있습니다. 또한 각 유전자 분석방식마다 장단점이 있기때문에 적어도 2개정도의 유전자 분석 검사를 보여서 과학적 안정성을 증명하는 것입니다. 제 생각에는 일단은 기본적으로 캠밸 생물학에 나오는 분자서열 염기및 유전학에 대한 지식 (70% 정도 이해 요구)과 진화론에 대한 지식을 적어도 90% 정도는 이해하시고, 그다음에 아무 서적중 evoltution 에 대한 텍스트북을 구입하신후 그 다음에 분자생태학 책을 보시면 이해가 가능하실겁니다. 저는 분자생태학책은 아래 책을 권유합니다. 학사때 교수님이 강의 서적으로 쓰시던 책이고, 또한 석사에서도 추천되는 서적인 만큼 유전자 분석을 이용해 동물생태학을 공부 하는 학도에게는 필수 서적이라고 권유하고 싶습니다. https://www.amazon.com/Introduction-Molecular-Ecology-Trevor-Beebee/dp/0199292051/ref=sr_1_2?dchild=1&keywords=an+introduction+to+molecular+ecology&qid=1585491936&sr=8-2 |
2020-03-30
01:05:00
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| 김건혁 |
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분자생태학이라는 말은 사실 처음 들어보고, 많이 생소합니다. 그런 책이 있다는 것도 처음 알게 되었습니다.
계속 도움을 주시고, 조언과 유용한 서적 추천 모두 감사드립니다. 열심히 찾아보며 공부하겠습니다! |
2020-03-31
15:21:39
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| 여치 |
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저도 현재 배우고 있는중입니다. 너무 그러지 마세요, :) |
2020-03-31
18:23:54
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| 여치 |
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https://www.ibric.org/myboard/read.php?Board=news&id=303673&BackLink=L215Ym9hcmQvbGlzdC5waHA/Qm9hcmQ9bmV3cyZQQVJBMz00OQ==
이글을 읽으시면 아마 방향을 잡으시는데 훨씬 수월하실것입니다. 저도 지금 찾았는데 글 내용이 좋더라고요. |
2020-03-31
18:51:15
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